Il porto di Sestri Levante è formato da due pontili e un molo. Il molo si estende verso nord per circa 250 metri e si trova vicino a uno dei pontili. L’altro pontile è situato a nord-ovest dell’Ufficio Marittimo e vi si possono ormeggiare soltanto barche di piccole dimensioni. Il pontile Adua è riservato allo scarico del pesce e al varo dei natanti, mentre il pontile Margherita è adibito all’attracco delle motobarche che trasportano passeggeri.

I posti barca disponibili sono 150, di cui 6 riservati al transito. Nella banchina riservata al transito si può ormeggiare esclusivamente di poppa e sono autorizzate a farlo solo le imbarcazioni che non superano la lunghezza di 20 metri. In tale banchina è possibile sostare gratuitamente per cinque giorni, prorogabili ad altri cinque in caso di disponibilità. La gestione degli ormeggi è amministrata dalla Lega Navale e dallo Yacht Club. Una volta entrati in porto non si può superare la velocità massima di tre nodi e per poter ormeggiare è necessario chiedere il permesso all’autorità marittima. Al di fuori dell’area portuale è possibile dare fondo all’ancora, ma dal 1 maggio al 30 settembre tale ancoraggio è vietato.